Difference between revisions of "VASP make"

From UFRC
Jump to navigation Jump to search
(Created page with "=== Makefile for VASP 5 === <source lang=make> .SUFFIXES: .inc .f .f90 .F SUFFIX=.f90 FC=mpif90 FCL=$(FC) FFLAGS = -free -lowercase -assume byterecl OFLAG=-O3 OFLAG_HIGH ...")
 
 
(8 intermediate revisions by 3 users not shown)
Line 1: Line 1:
−
=== Makefile for VASP 5 ===
+
[[Category:Software]]
−
<source lang=make>
+
[[VASP|Back to VASP page]]
−
.SUFFIXES: .inc .f .f90 .F
 
−
SUFFIX=.f90
 
  
−
FC=mpif90
+
The latest VASP uses makefile.include to set up compiler options/flags. Here is one example makefile.include file that was used to build VASP with OpenMPI on HiPerGator. Before compiling, you need to load intel and openmpi modules.
−
FCL=$(FC)
 
  
−
FFLAGS = -free -lowercase -assume byterecl
+
=== makefile.include for VASP 5 ===
−
 
+
<source lang=make>
−
OFLAG=-O3
+
# Precompiler options
−
OFLAG_HIGH = $(OFLAG)
+
CPP_OPTIONS= -DMPI -DHOST=\"IFC91_ompi\" -DIFC \
−
OBJ_HIGH =  
+
            -DnoAugXCmeta \
−
OBJ_NOOPT =  
+
            -DPGF90 \
−
DEBUG  = -free -O0
+
            -DMPI -DMPI_BLOCK=8000 \
−
INLINE = $(OFLAG)
+
            -Duse_collective \
−
#-----------------------------------------------------------------------
+
            -DCACHE_SIZE=4000 \
−
# additional options for CPP in parallel version (see also above):
+
            -Davoidalloc \
−
# NGZhalf              charge density  reduced in Z direction
+
            -Duse_bse_te \
−
# wNGZhalf              gamma point only reduced in Z direction
+
            -Dtbdyn \
−
# scaLAPACK            use scaLAPACK (usually slower on 100 Mbit Net)
+
            -Duse_shmem
−
#-----------------------------------------------------------------------
 
−
# Define these when using MKL BLAS?
 
−
#    -DRPROMU_DGEMV  -DRACCMU_DGEMV
 
−
#-----------------------------------------------------------------------
 
−
CPP_ = ./preprocess <$*.F | /usr/bin/cpp -P -C -traditional >$*$(SUFFIX)
 
−
 
 
−
CPP  = $(CPP_) -DHOST=\"LinuxUFHPC\" \
 
−
-DMPI \
 
−
-DIFC \
 
−
-DPGF90 \
 
−
-Dkind8 \
 
−
-DNGZhalf \
 
−
-Davoidalloc \
 
−
-DMPI_BLOCK=8000  \
 
−
-DCACHE_SIZE=4000 \
 
−
-DscaLAPACK
 
−
#-----------------------------------------------------------------------
 
−
# MKL 10.X
 
−
# set -DRPROMU_DGEMV  -DRACCMU_DGEMV in the CPP lines
 
−
#
 
−
MKLDIR  = -L/opt/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t
 
−
MKLCORE = -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core
 
−
MKL    = $(MKLDIR) $(MKLCORE)
 
−
#-----------------------------------------------------------------------
 
−
 
 
−
#-----------------------------------------------------------------------
 
−
# GOTO BLAS Library (Slightly faster than MKL)
 
−
# http://www.cs.utexas.edu/users/kgoto/signup_first.html
 
−
#
 
−
BLAS = -L/opt/lib/goto/1.26 lgoto_penrynp-r1.26
 
−
#-----------------------------------------------------------------------
 
−
 
 
−
#-----------------------------------------------------------------------
 
−
# ScaLaPack + BLACS
 
−
#
 
−
SCA    = -L/opt/lib/scalapack/intel10/mvapich -lscalapack
 
−
BLACS  = -L/opt/lib/blacs/intel10/mvapich -lBlacsF77Init -lBlacsCInit -lBlacs
 
−
 
 
−
SCALAPACK = $(SCA) $(BLACS)
 
−
#-----------------------------------------------------------------------
 
−
 
 
−
#-----------------------------------------------------------------------
 
−
# MKL FFTs w/ FFTW wrappers
 
−
#
 
−
FFTLIB  = -lfftw3xf_intel
 
−
 
 
−
# Bonifide FFTW 3.1.2
 
−
#FFTLIB  = -L/opt/intel/fftw/3.1.2/lib -lfftw3
 
−
#-----------------------------------------------------------------------
 
−
 
 
−
#-----------------------------------------------------------------------
 
−
# Miscellaneous VASP routines
 
−
 
 
−
MISC = -L../vasp.5.lib -ldmy
 
−
#-----------------------------------------------------------------------
 
−
 
 
−
LIBS = $(MISC) $(FFTLIB) $(SCALAPACK) $(BLAS) $(MKL)
 
−
 
 
−
LINK  = -i_dynamic -Wl,-rpath -Wl,$(MKLDIR)
 
−
#-----------------------------------------------------------------------
 
−
# general rules and compile lines
 
−
#-----------------------------------------------------------------------
 
−
LPD_OBJS = ../vasp.5.lib/linpack_double.o
 
−
FFT_OBJS = fftmpi.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o 
 
−
 
 
−
BASIC =  symmetry.o symlib.o  lattlib.o  random.o 
 
−
 
 
−
SOURCE = base.o    mpi.o      smart_allocate.o      xml.o  \
 
−
        constant.o jacobi.o  main_mpi.o  scala.o  \
 
−
        asa.o      lattice.o  poscar.o  ini.o      xclib.o    xclib_grad.o \
 
−
        radial.o  pseudo.o  mgrid.o    gridq.o    ebs.o  \
 
−
        mkpoints.o wave.o    wave_mpi.o  wave_high.o  \
 
−
        $(BASIC)  nonl.o    nonlr.o    nonl_high.o dfast.o    choleski2.o \
 
−
        mix.o      hamil.o    xcgrad.o  xcspin.o    potex1.o  potex2.o  \
 
−
        metagga.o constrmag.o cl_shift.o relativistic.o LDApU.o \
 
−
        paw_base.o egrad.o    pawsym.o  pawfock.o  pawlhf.o    paw.o  \
 
−
        mkpoints_full.o      charge.o  dipol.o    pot.o  \
 
−
        dos.o      elf.o      tet.o      tetweight.o hamil_rot.o \
 
−
        steep.o    chain.o    dyna.o    sphpro.o    us.o  core_rel.o \
 
−
        aedens.o  wavpre.o  wavpre_noio.o broyden.o \
 
−
        dynbr.o    rmm-diis.o reader.o  writer.o  tutor.o xml_writer.o \
 
−
        brent.o    stufak.o  fileio.o  opergrid.o stepver.o  \
 
−
        chgloc.o  fast_aug.o fock.o    mkpoints_change.o sym_grad.o \
 
−
        mymath.o  internals.o dimer_heyden.o dvvtrajectory.o vdwforcefield.o \
 
−
        hamil_high.o nmr.o    force.o \
 
−
        pead.o    subrot.o  subrot_scf.o pwlhf.o  gw_model.o optreal.o  davidson.o \
 
−
        electron.o rot.o  electron_all.o shm.o    pardens.o  paircorrection.o \
 
−
        optics.o  constr_cell_relax.o  stm.o    finite_diff.o elpol.o    \
 
−
        hamil_lr.o rmm-diis_lr.o  subrot_cluster.o subrot_lr.o \
 
−
        lr_helper.o hamil_lrf.o  elinear_response.o ilinear_response.o \
 
−
        linear_optics.o linear_response.o  \
 
−
        setlocalpp.o  wannier.o electron_OEP.o electron_lhf.o twoelectron4o.o \
 
−
        ratpol.o screened_2e.o wave_cacher.o chi_base.o wpot.o local_field.o \
 
−
        ump2.o bse.o acfdt.o chi.o sydmat.o
 
−
 
 
−
INC =
 
−
 
 
−
vasp: $(SOURCE) $(FFT_OBJS) $(INC) main.o
 
−
        rm -f vasp
 
−
        $(FCL) -o vasp main.o  $(SOURCE) $(LPD_OBJS) $(FFT_OBJS) $(LIBS) $(LINK)
 
−
makeparam: $(SOURCE) $(FFT_OBJS) makeparam.o main.F $(INC)
 
−
        $(FCL) -o makeparam  $(LINK) makeparam.o $(SOURCE) $(FFT_OBJS) $(LIBS)
 
−
zgemmtest: zgemmtest.o base.o random.o $(INC)
 
−
        $(FCL) -o zgemmtest $(LINK) zgemmtest.o random.o base.o $(LIBS)
 
−
dgemmtest: dgemmtest.o base.o random.o $(INC)
 
−
        $(FCL) -o dgemmtest $(LINK) dgemmtest.o random.o base.o $(LIBS)
 
−
ffttest: base.o smart_allocate.o mpi.o mgrid.o random.o ffttest.o $(FFT_OBJS) $(INC)
 
−
        $(FCL) -o ffttest $(LINK) ffttest.o mpi.o mgrid.o random.o smart_allocate.o base.o $(FFT_OBJS) $(LIBS)
 
−
kpoints: $(SOURCE) $(FFT_OBJS) makekpoints.o main.F $(INC)
 
−
        $(FCL) -o kpoints $(LINK) makekpoints.o $(SOURCE) $(FFT_OBJS) $(LIBS)
 
−
 
 
−
clean:
 
−
        -rm -f *.g *.f *.f90 *.o *.L *.mod ; touch *.F
 
−
 
 
−
main.o: main$(SUFFIX)
 
−
        $(FC) $(FFLAGS)$(DEBUG)  $(INCS) -c main$(SUFFIX)
 
−
xcgrad.o: xcgrad$(SUFFIX)
 
−
        $(FC) $(FFLAGS) $(INLINE)  $(INCS) -c xcgrad$(SUFFIX)
 
−
xcspin.o: xcspin$(SUFFIX)
 
−
        $(FC) $(FFLAGS) $(INLINE)  $(INCS) -c xcspin$(SUFFIX)
 
−
 
 
−
makeparam.o: makeparam$(SUFFIX)
 
−
        $(FC) $(FFLAGS)$(DEBUG)  $(INCS) -c makeparam$(SUFFIX)
 
  
−
makeparam$(SUFFIX): makeparam.F main.F
+
CPP        = fpp -f_com=no -free -w0  $*$(FUFFIX) $*$(SUFFIX) $(CPP_OPTIONS)
−
#
 
−
base.o: base.inc base.F
 
−
mgrid.o: mgrid.inc mgrid.F
 
−
constant.o: constant.inc constant.F
 
−
lattice.o: lattice.inc lattice.F
 
−
setex.o: setexm.inc setex.F
 
−
pseudo.o: pseudo.inc pseudo.F
 
−
poscar.o: poscar.inc poscar.F
 
−
mkpoints.o: mkpoints.inc mkpoints.F
 
−
wave.o: wave.inc wave.F
 
−
nonl.o: nonl.inc nonl.F
 
−
nonlr.o: nonlr.inc nonlr.F
 
  
−
$(OBJ_HIGH):
+
FC         = mpif90 -msse3 -axcore-avx2,core-avx-i
−
         $(CPP)
+
FCL        = mpif90 -mkl
−
        $(FC) $(FFLAGS) $(OFLAG_HIGH) $(INCS) -c $*$(SUFFIX)
 
−
$(OBJ_NOOPT):
 
−
        $(CPP)
 
−
        $(FC) $(FFLAGS) $(INCS) -c $*$(SUFFIX)
 
  
−
fft3dlib_f77.o: fft3dlib_f77.F
+
FREE      = -free -names lowercase
−
        $(CPP)
 
−
        $(F77) $(FFLAGS_F77) -c $*$(SUFFIX)
 
  
−
.F.o:
+
FFLAGS    = -assume byterecl -w
−
        $(CPP)
+
OFLAG     = -O2 -msse3 -axcore-avx2,core-avx-i
−
        $(FC) $(FFLAGS) $(OFLAG) $(INCS) -c $*$(SUFFIX)
+
OFLAG_IN  = $(OFLAG)
−
.F$(SUFFIX):
+
DEBUG      = -O0
−
        $(CPP)
 
−
$(SUFFIX).o:
 
−
        $(FC) $(FFLAGS) $(OFLAG) $(INCS) -c $*$(SUFFIX)
 
  
−
# special rules
+
INCS      =-I$(MKLROOT)/include/fftw
−
#-----------------------------------------------------------------------
 
  
−
fft3dlib.o : fft3dlib.F
+
#LAPACK    = -lmkl_scalapack_lp64
−
        $(CPP)
+
BLACS      = -lmkl_blacs_openmpi_lp64
−
        $(FC) -free -lowercase -O2 -c $*$(SUFFIX)
+
#SCALAPACK  = $(LAPACK) $(BLACS)
−
fft3dfurth.o : fft3dfurth.F
+
BLAS      = -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core
−
        $(CPP)
+
FFTLIB    = -lfftw3xf
−
        $(FC) -free -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX)
 
  
−
radial.o : radial.F
+
#OBJECTS    = fftmpi.o fftmpi_map.o fft3dfurth.o fft3dlib.o
−
        $(CPP)
+
OBJECTS    = fftmpiw.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o \
−
        $(FC) -free -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX)
 
  
−
symlib.o : symlib.F
+
LLIBS      = -L$(HPC_MKL_LIB) $(BLAS)  
−
        $(CPP)
 
−
        $(FC) -free -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX)
 
  
−
symmetry.o : symmetry.F
+
OBJECTS_O1 += fft3dfurth.o fftw3d.o fftmpi.o fftmpiw.o
−
        $(CPP)
+
OBJECTS_O2 += fft3dlib.o
−
        $(FC) -free -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX)
 
  
−
wave_mpi.o : wave_mpi.F
+
# For what used to be vasp.5.lib
−
        $(CPP)
+
CPP_LIB    = $(CPP)
−
        $(FC) -free -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX)
+
FC_LIB    = $(FC)
 +
CC_LIB    = icc -msse3 -axcore-avx2,core-avx-i
 +
CFLAGS_LIB = -O
 +
FFLAGS_LIB = -O1
 +
FREE_LIB  = $(FREE)
  
−
wave.o : wave.F
+
OBJECTS_LIB= linpack_double.o getshmem.o
−
        $(CPP)
 
−
        $(FC) -free -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX)
 
  
−
dynbr.o : dynbr.F
+
# For the parser library
−
        $(CPP)
+
CXX_PARS  = icpc
−
        $(FC) -free -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX)
 
  
−
asa.o : asa.F
+
LIBS      += parser
−
        $(CPP)
+
LLIBS      += -Lparser -lparser -lstdc++
−
        $(FC) -free -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX)
 
  
−
broyden.o : broyden.F
+
# Normally no need to change this
−
        $(CPP)
+
SRCDIR    = ../../src
−
        $(FC) -free -lowercase -O2 -c $*$(SUFFIX)
+
BINDIR    = ../../bin
  
−
us.o : us.F
 
−
        $(CPP)
 
−
        $(FC) -free -lowercase -O1 -c $*$(SUFFIX)
 
  
−
LDApU.o : LDApU.F
 
−
        $(CPP)
 
−
        $(FC) -free -lowercase -O2 -c $*$(SUFFIX)
 
 
</source>
 
</source>

Latest revision as of 03:23, 17 April 2018

Back to VASP page

The latest VASP uses makefile.include to set up compiler options/flags. Here is one example makefile.include file that was used to build VASP with OpenMPI on HiPerGator. Before compiling, you need to load intel and openmpi modules.

makefile.include for VASP 5

# Precompiler options
CPP_OPTIONS= -DMPI -DHOST=\"IFC91_ompi\" -DIFC \
             -DnoAugXCmeta \
             -DPGF90 \
             -DMPI -DMPI_BLOCK=8000 \
             -Duse_collective \
             -DCACHE_SIZE=4000 \
             -Davoidalloc \
             -Duse_bse_te \
             -Dtbdyn \
             -Duse_shmem 

CPP        = fpp -f_com=no -free -w0  $*$(FUFFIX) $*$(SUFFIX) $(CPP_OPTIONS)

FC         = mpif90 -msse3 -axcore-avx2,core-avx-i
FCL        = mpif90 -mkl

FREE       = -free -names lowercase

FFLAGS     = -assume byterecl -w
OFLAG      = -O2 -msse3 -axcore-avx2,core-avx-i 
OFLAG_IN   = $(OFLAG)
DEBUG      = -O0

INCS       =-I$(MKLROOT)/include/fftw

#LAPACK     = -lmkl_scalapack_lp64
BLACS      = -lmkl_blacs_openmpi_lp64
#SCALAPACK  = $(LAPACK) $(BLACS)
BLAS       = -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core
FFTLIB     = -lfftw3xf

#OBJECTS    = fftmpi.o fftmpi_map.o fft3dfurth.o fft3dlib.o
OBJECTS    = fftmpiw.o fftmpi_map.o fftw3d.o fft3dlib.o \

LLIBS      = -L$(HPC_MKL_LIB) $(BLAS) 

OBJECTS_O1 += fft3dfurth.o fftw3d.o fftmpi.o fftmpiw.o
OBJECTS_O2 += fft3dlib.o

# For what used to be vasp.5.lib
CPP_LIB    = $(CPP)
FC_LIB     = $(FC)
CC_LIB     = icc -msse3 -axcore-avx2,core-avx-i
CFLAGS_LIB = -O
FFLAGS_LIB = -O1
FREE_LIB   = $(FREE)

OBJECTS_LIB= linpack_double.o getshmem.o

# For the parser library
CXX_PARS   = icpc

LIBS       += parser
LLIBS      += -Lparser -lparser -lstdc++

# Normally no need to change this
SRCDIR     = ../../src
BINDIR     = ../../bin
Retrieved from "https://help.rc.ufl.edu/mediawiki/index.php?title=VASP_make&oldid=17610"